Na Univerzitetu Sinergija organizovane su trogodišnje i četvorogodišnje osnovne studije, nakon čega diplomac u skladu sa važećim zakonskim propisima Republike Srpske dobija diplomu visoke školske spreme.

Projektovani studijski programi po kojima se studira rezultat je nastojanja da se u najvećoj meri ostvare savremeni evropski naučni, stručni i pedagoški standardi i studentima omogući sticanje širokog i sveobuhvatnog teorijskog, a posebno praktičnog znanja neophodnog za obavljanje stručnog poziva.

Posebnu vrednost studija ovog Univerziteta predstavlja način izvođenja nastave, koju karakteriše i mentorski rad, rad u grupama optimalne veličine, polaganje ispita preko kolokvijuma i pristupnih radova. U zavisnosti od obrazovnog profila za koji se opredeljuju, studenti su u prilici da obavljaju različite oblike stručne prakse u preduzećima, javnim službama, sudovima i drugim organizacijama. To su samo neke od vrednosti koje studenta stavljaju u centar pažnje i deluju podsticajno na njegov rad.

Studijski programi Univerziteta mogu pretrpeti izmene za vreme studija radi usavršavanja i osavremenjavanja nastavnog procesa. Student ima pravo da studije završi po nastavnom planu koji je važio u momentu upisa. Međutim, ako posle ponovljene godine ne ispuni uslov za upis naredne godine, student nastavlja studije po novom studijskom programu.